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糖尿病數(shù)據(jù)的可視化分析

2018-07-31    來源:raincent

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最近,國產電影《我不是藥神》正在上映,這部根據(jù)真實性故事改編的電影,通過對病人群體的描寫,引發(fā)了社會對于醫(yī)療問題的大討論。作為一位長期關注臨床健康問題的統(tǒng)計學家,數(shù)據(jù)科學家 John Yap 希望用數(shù)據(jù)可視化的方式,幫助人們更好地認識疾病。這次,他把目光聚焦在了糖尿病問題上。

疾病是人類生活的一部分。我們的歷史上一直不斷和疾病抗爭:從公元前430年在雅典爆發(fā)的天花到最近幾年肆虐美洲大陸的寨卡病毒。幸運的是,科技發(fā)展給現(xiàn)代醫(yī)學帶來的治療方法的變革,已經幫助人們取得了抗爭疾病的更高效的方法。而臨床試驗就是這些科學方法的核心。

臨床醫(yī)學對糖尿病的治療帶來很大幫助。我制作了這個R Shiny app原型(你還可以登錄我的 Github頁面查看源代碼,自己做一些更多的探索),它的目標是對美國的糖尿病臨床研究信息,這些信息可以用在以下情況:

•  糖尿病患者對參與新藥物、新治療方法的臨床試驗感興趣,或者想在未來第一時間知道臨床研究的新消息;

•  你對藥物學感興趣,并且想了解更多有關現(xiàn)實中的臨床試驗的知識;

•  你是醫(yī)療工作者,想要了解臨床實驗的贊助商們,以及可能影響到你所在機構的臨床試驗的最新進展;

•  你對投資藥物研究感興趣,想要了解贊助數(shù)據(jù)、產品生產數(shù)據(jù)等;

這個項目的靈感來自 Xiao Jia 之前的一個項目。數(shù)據(jù)集來自 ClinicalTrials.gov,一個存儲美國和世界各國臨床試驗數(shù)據(jù)的網站,資源來自美國國家醫(yī)學圖書館。

為了創(chuàng)建一個App,我的研究僅僅局限在一種特定的疾病(糖尿病),贊助商只包含美國本土的機構,而且以兩個主要的研究類型(臨床試驗和觀察性研究)為主。簡單來說,臨床試驗通常是在一種藥物或治療方式推向公眾之前,小范圍進行的測試。而觀察性研究則是在藥物已經上市后,進行的安全性評估。

App主頁面上有五類信息:簡介,研究信息,年度數(shù)據(jù),贊助數(shù)據(jù)以及地圖。簡介是以視頻形式呈現(xiàn)。研究信息會展示比如贊助類型、糖尿病種類、治療模式、研究進展等特定信息,以柱狀圖呈現(xiàn);谶@個功能我得出一些發(fā)現(xiàn):

•  糖尿病的臨床試驗數(shù)量多于觀察性研究的數(shù)量;

•  研究通常來自醫(yī)藥公司等行業(yè)內公司以及其他機構(一些學術或非盈利組織贊助);

•  最常見的干預類型包括藥物干預,行為干預以及器械干預。

 

 

 

 

年度數(shù)據(jù)的功能展示了每年開始或完成的研究數(shù)。如果我們看一看不同年份開始的研究數(shù)據(jù),會發(fā)現(xiàn):

•  大多數(shù)研究是由行業(yè)或者其他(研究機構、非營利組織)機構來資助的

2000年到2010年間,由行業(yè)或其他機構資助的臨床試驗陡增。一個可能的原因是糖尿病在這幾年成為一個嚴重的公共安全隱患,引發(fā)更多的研究。

2010年之后,由行業(yè)資助的研究數(shù)下降,由其他機構資助的保持不變。這可能意味著行業(yè)內不再認為研究糖尿病的治療能夠帶來商業(yè)回報?這個現(xiàn)象值得深入研究。

 

 

贊助數(shù)據(jù)以表格形式展示,對不同贊助商的數(shù)據(jù)進行收集整理。表格包括每個贊助商資助的研究數(shù),以及參與者(參與總數(shù)、平均值、最小及最大值)和時長(平均值、近幾年的最小和最大值)的概況。從中你會發(fā)現(xiàn):

•  資助項目最多的10個贊助商中,7個來自行業(yè)內

•  AstraZeneca資助了最多的研究(168項)

•  國家糖尿病、消化系統(tǒng)及腎臟系統(tǒng)疾病協(xié)會排名前三

 

 

在地圖的功能上,我們展示了贊助商在全國的分布情況。你可以選擇查看不同的研究類型并放大地圖查看。最初的地點標示以塊狀展示,當你放大后會分散開,顯示更具體的信息。這可以讓你看到自己所在區(qū)域是否有相應的臨床試驗。

 

 

這個app僅僅用了兩周左右時間完成。如果有更多時間和精力,它可以在以下方面得到提升:

•  將其他疾病也納入其中

•  將美國以外的贊助商也納入其中

•  將更多研究類型,比如注冊研究等納入其中

另外還可以加入更多的功能,比如顯示疾病發(fā)生所在地信息、受資助的臨床試驗的進展階段。這些額外的功能能夠幫助想要長期投資藥物領域的投資者更好地選擇贊助商。這會提高App的商業(yè)價值。

(本文編譯自技術博客 Visualizing Diabetes Clinical Studies Data 僅代表作者觀點。)

John Yap是一名在臨床試驗以及觀察性研究方面有多年工作經驗的統(tǒng)計學家。

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